百度在2009年年末推出凤巢系统调整了“竞价排名”模式，由“明拍”调整为“暗拍”，也就是各个广告商在投放时无法看到其他家出价的情况，于是广告商在无法知道对方出价的情况下，为了获取位置，只能最大限度抬高自己的报价。
据前述的北京莆田系医院院长介绍，无序竞价导致了民营医院同行们无序的竞争，“百度竞价排名按照次数收费，排名顺序则是根据价格高低，即如果有市民在进行百度搜索时，医院要让搜索结果中出现自己，并且排名靠前，就要不停的付费加价。如一家医院100元购得下一次排名第一，而如果另一家医院出价101元，那后者的排名就超过前者”。
众多的关键词也使得民营医院们被迫选择“割肉”，据上述院长介绍，比如搜索他所在的整容医院，关键词可以是“整容医院”、“整形医院”、“美容医疗”、“哪家医院丰胸好”等多个关键词，“如果想自家医院出现在搜索结果的第一页。就需要为这些数不清的关键词搜索排名买单”。
据网易财经了解，就目前而言，在北上广深等一线城市，民营医院每年在百度竞价上的投放额度最高能达到3000万元/家左右，绝大多数省会城市的民营医院每年每家的投放额最高能达到1000万元左右，而其他的一些民营医院在百度的投放则从几十万元/年到几百万元/年不等。
北京望好投资副总裁夏秀瑜向网易财经指出，相比几年前，新开一家民营医院半年即可“回本”的利好，现在他们新开的医院往往需要7到8年才能收支平衡，“越来越多的莆田人开始自问：当每年医院的营收大部分流入百度的腰包，那我们辛辛苦苦折腾一年是在为谁打工？”
同样在湖北开设民营医院的黄先生向网易财经表示，从近两年来看，民营医院的行业的暴利时代已经过去，“现在一家民营医院想要维持盈利，所付出的辛苦要比几年前多得多”。
在黄先生看来，成本的上升，不仅仅体现在搜索引擎关键词的恶性竞价，“员工工资和租赁物业的费用都在大幅上涨，其中用人成本的年涨幅在10%左右，而房屋租金的年涨幅则会更高”。
一位不愿具名的莆田系医疗集团高管向网易财经指出，目前中国民营医疗机构的经营现状是两极化严重，“行业能基本达成共识的是，目前有30%的民营医院盈利不错，30%的能够做到收支平衡，40%左右处于亏损”。
然而并不是所有的路都已经堵死。2013年10月14日，国务院印发了备受医疗界关注的40号文件，其中明确提出大力引入社会资本进入健康服务行业。于是大量资本雄厚的企业开始涌入民营医院领域，莆田系医疗机构也在适时做出改变。